Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CRC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CRC3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CRC3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms