Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms