Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp5sQ9CRA7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp5sQ9CRA7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms