Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4931417E11RikQ9CR05 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4931417E11RikQ9CR05 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms