Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg12Q9CQY1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg12Q9CQY1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms