Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ykt6Q9CQW1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ykt6Q9CQW1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms