Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Map1lc3bQ9CQV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Map1lc3bQ9CQV6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms