Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PompQ9CQT5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PompQ9CQT5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms