Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl20Q9CQL4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms