Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf2Q9CQJ4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms