Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp2Q9CQ73 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp2Q9CQ73 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp2Q9CQ73 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms