Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Commd4Q9CQ02 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Commd4Q9CQ02 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms