Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim26Q99PN3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim26Q99PN3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms