Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtn4rQ99PI8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtn4rQ99PI8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtn4rQ99PI8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms