Protein–RNA interactions for Protein: Q99PB1

1700020D05Rik, Mage-g2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020D05RikQ99PB1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
1700020D05RikQ99PB1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700020D05RikQ99PB1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms