Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtn4Q99P72 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtn4Q99P72 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtn4Q99P72 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms