Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms