Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cep41Q99NF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep41Q99NF3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep41Q99NF3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms