Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rims1Q99NE5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rims1Q99NE5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rims1Q99NE5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms