Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll1Q99NC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vgll1Q99NC0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vgll1Q99NC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms