Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atoh8Q99NA2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atoh8Q99NA2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms