Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl43Q99N89 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Mrpl43Q99N89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl43Q99N89 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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