Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brms1Q99N20 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brms1Q99N20 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brms1Q99N20 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms