Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc12a9Q99MR3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a9Q99MR3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a9Q99MR3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms