Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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Rcbtb2Q99LJ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rcbtb2Q99LJ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rcbtb2Q99LJ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rcbtb2Q99LJ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rcbtb2Q99LJ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rcbtb2Q99LJ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Rcbtb2Q99LJ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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