Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms