Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Clp1Q99LI9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clp1Q99LI9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clp1Q99LI9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Clp1Q99LI9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Clp1Q99LI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Clp1Q99LI9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clp1Q99LI9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Clp1Q99LI9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clp1Q99LI9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clp1Q99LI9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clp1Q99LI9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clp1Q99LI9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clp1Q99LI9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms