Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pagr1aQ99L02 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms