Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vmp1Q99KU0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmp1Q99KU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms