Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NgrnQ99KS2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NgrnQ99KS2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NgrnQ99KS2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NgrnQ99KS2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms