Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PpifQ99KR7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PpifQ99KR7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms