Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlcd1Q99JT6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlcd1Q99JT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms