Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg5Q99J83 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg5Q99J83 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg5Q99J83 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms