Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Lmo1Q924W9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Lmo1Q924W9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Lmo1Q924W9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmo1Q924W9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Lmo1Q924W9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmo1Q924W9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms