Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf7Q922B6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf7Q922B6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms