Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Med28Q920D3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms