Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6cQ91ZQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pde6cQ91ZQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms