Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trpm2Q91YD4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trpm2Q91YD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms