Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klc3Q91W40 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klc3Q91W40 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klc3Q91W40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klc3Q91W40 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms