Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp3Q91W36 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp3Q91W36 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms