Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zkscan3Q91VW9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zkscan3Q91VW9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3Q91VW9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms