Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2cQ91VK4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2cQ91VK4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2cQ91VK4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms