Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpcsQ8VDG5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpcsQ8VDG5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpcsQ8VDG5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms