Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt25Q8VCW2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt25Q8VCW2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt25Q8VCW2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms