Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11fip5Q8R361 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11fip5Q8R361 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms