Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc12Q8R344 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc12Q8R344 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms