Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pof1bQ8K4L4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pof1bQ8K4L4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms