Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casc3Q8K3W3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Casc3Q8K3W3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms