Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssh3Q8K330 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssh3Q8K330 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Ssh3Q8K330 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms