Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nsl1Q8K305 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nsl1Q8K305 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nsl1Q8K305 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms